28至31節，馬大回去暗暗的叫她妹子馬利亞說：「夫子來了，叫你。」為何馬大要「暗暗的」叫馬利亞，經文沒有明說，或許她認為主耶穌只是想見馬利亞，不想讓別人知道她們去見祂，於是希望不驚動其他人。但馬利亞聽了隨即急忙起來，到主耶穌那裡去。那時，主耶穌還沒有進村子，仍在馬大迎接祂的地方。相信馬利亞急忙起身的反應，引起那些正在安慰她的猶太人注意，他們就跟著她出去，以為她要往墳墓那裡去哭。這些人只是想陪伴馬利亞而同去，他們沒有想到會見到主耶穌，更想不到會看見死人復活的大神蹟。
32至35節，馬利亞到了主耶穌那裡，她俯伏在主腳前，筆者認為她的表現是傷心感情的流露，繼而以憂傷埋怨的口吻對主說：「主啊，你若早在這裡，我兄弟必不死。」馬大在本章21節也講過相同的話，她姊妹同樣有信心主能治好生前的拉撒路，但現在人已死了，同樣講出絕望的話來。但馬大與馬利亞見到主所表現情緒不大相同，前者是與論到祈求與復活的真理。後者沒有講什麼復活的道理。聖經記載主看見馬利亞哭，並看見與她同來的猶太人也哭，就心裡悲歎，又甚憂愁。按原文的字義，「悲歎」是含有氣憤、責罵、生氣的意思，故有學者將此詞譯為「悲憤」。然而，主耶穌為何會因為見到他們哭就心裡悲憤呢？有可能是像保羅論到睡了的人時所說：「我們不願意弟兄們不知道，恐怕你們憂傷，像那些沒有指望的人一樣。（參帖前4:12）」按此理解，主耶穌是悲憤馬利亞她們憂傷得像那些沒有指望的人一樣，當然這並不表示主在責備她們，因為經文同時記載主耶穌「又甚憂愁」，顯然主耶穌因馬利亞的難過而與她同憂，也表明主對人的體恤。主耶穌問馬利亞和與她在一起來的猶太人，他們把拉撒路安放在哪裡。他們回答說：「請主來看。」然後使徒約翰寫道「耶穌哭了」。耶穌的哭不會是因為對「人死不能復生」而絕望，因為祂必定知道拉撒路馬上要復活了。從理性分析的角度，實在不容易明白主耶穌為何會哭。從原文字義看，馬利亞的哭是慟哭（哀悼痛哭），主耶穌的「哭」是流淚（此「哭」字在新約聖經原文中只出現了一次），並且主耶穌不是在見到馬利亞哭時便流淚，那時祂只是「又甚憂愁」。祂是去到埋葬拉撒路的地方才「流淚」，筆者相信主耶穌那時不只是與哀哭的人同哭，也可能是因祂聯想到人類面對的滅亡而難過，正如在路加福音19章41節「耶穌快到耶路撒冷，看見城，就為它哀哭。」
36至37節，猶太人看見耶穌在拉撒路墳前哭，就說：「你看他愛這人是何等懇切。」他們以為主是因深愛拉撒路而傷心難過。但其中有人卻說：「祂既然開了瞎子的眼睛，豈不能叫這人不死嗎？」說這話的人顯然是曾經看見或聽見主耶穌開了瞎子的眼，他們也與馬利亞和馬大的想法相仿，若主耶穌能夠趕在拉撒路死前來到，也應能叫拉撒路不死。
38至44節，當有人又發出埋怨的說話時（37節），顯示他們的不信，主耶穌又再次心裡悲歎（悲憤）。祂來到墳墓前，那墳墓是個洞，有一塊石頭擋著。從經文的形容，可見那墳墓是個山洞，當拉撒路死後，便被放進洞裡，並以石頭封著洞口。主耶穌站在墳墓前面說：「你們把石頭挪開。」首先有反應的是那死人的姐姐馬大，她對主說：「主啊，他現在必是臭了，因為他死了已經四天了。」同時她也沒有問主耶穌要挪開石頭的原因。在本章23至27節，雖然主耶穌已明明告訴她「復活在祂」，但馬大卻想不到主會在此時復活她弟弟。反而她認為屍體已洞內四天，屍體開始腐爛，應該已經發臭。主耶穌沒有詳細解釋搬開石頭的原因，只重申祂說過的話，即「我不是對你說過，你若信，就必看見神的榮耀？」馬大便沒有再追問，她應該是請身旁的猶太人幫助，將石頭挪開。就在此時，主耶穌不是隨即施行神蹟，祂先舉目望天禱告說：「父啊，我感謝你，因為你已經聽我。我也知道你常聽我，但我說這話是為周圍站著的眾人，叫他們信是你差了我來。」從主禱告的內容，我們看到主耶穌和父神的關係是何等的親密，但我們也看到祂這樣說原來不是為自己，而是為周圍站著的眾人。祂的目的非常清楚，就是叫周圍的人信祂是父神差來的。原來主耶穌這樣「高調」是為這群不信的猶太人可以有機會相信主，當然還有祂的門徒、馬利亞和馬大，他們的信心也因此而得堅固和進深。主耶穌說了這話，就大聲呼叫說：「拉撒路出來！」那死了的拉撒路就出來，沒有什麼驚天動地或可怕的場面，主的話就如此簡單成就，死人便復活了。拉撒路從墳墓裡出來時，手腳還裹著布，臉上包著手巾。這是猶太人包裏屍體的方式，由於屍布包著身體，我們可以想像拉撒路出來時肯定不是走動自如。因此，主耶穌對他們說：「解開，叫他走！」當解開拉撒路時，相信他的身體也應全然回復正常，不會有任何腐爛的表現，神蹟就如此簡單完成了，周圍的所有人也確實看見了神的榮耀。將來有一天，當主再來，死人也都要復活，拉撒路的復活就如同將來在末日死人復活的預表。
45至48節，拉撒路復活以後，出現了兩個截然不同的反應，第一種是那些來看馬利亞的猶太人，他們見了主耶穌所做的事，就多有信祂的；第二種就是其中有猶太人去見法利賽人，將主耶穌所做的事都告訴他們。前者是因看見復活的神蹟信了主，但後者顯然知道這些法利賽人是要對付主耶穌，他們非但不信，他們這樣做是要通知法利賽人，採取相應行動來面對這次神蹟帶來的「挑戰」。結果祭司長和法利賽人聚集公會（猶太的公會由七十位委員組成，大祭司是公會主席，公會在羅馬統治下負責管理當地的猶太人，包括查控違反摩西律法的猶太人。）是次會議集中商討是如何應對主耶穌行好些神蹟後所帶來的影響。他們擔心若繼續任由主耶穌，人人都要信祂，甚至影響到政治層面，這局面會成為羅馬人對付他們的借口，因為主耶穌所行的神蹟使不少猶太人相信祂就是彌賽亞，祂會救他們脫羅馬人的手。羅馬政府將視之為對羅馬政權的威脅，如此便會招致羅馬政權的問責，結果他們不能再管治猶太人，他們將會失去地土（相信指的是聖殿）和他們管治的百姓（猶太人）。