16章31至33節，當門徒表示相信主耶穌是從神出來的（30節），主耶穌卻反問他們說：「現在你們信嗎？」為何主對門徒認信好像不以為然呢？從主下面的話，我們知道門徒真實的屬靈光景。主耶穌對門徒說：「看哪，時候將到，且是已經到了，你們要分散，各歸自己的地方去。」門徒當時信心應是誠實的（除了賣主的猶大），但當主耶穌被賣的那一夜，門徒面對忽然來的驚嚇，他們自以為的信心就崩潰了，「因無牧人，羊就分散」，他們也就各自逃跑回家了。表面上，那時門徒留下主耶穌獨自一人，但從屬靈的角度看，主耶穌其實不是獨自一人面對前面的苦難，因為有父神與祂同在，父神陪伴主耶穌面對被捉拿、受審和被惡待，惟有在十字架上，因為主耶穌要承擔世人的罪孽，聖潔的父神在那一刻才不得不掩面不看祂。雖然主耶穌知道門徒即將因害怕而四散，但祂還是將即將發生的事預先告訴門徒，目的不是指責或埋怨他們會離棄祂。主耶穌真的很愛門徒，祂知道當自己被害以後，他們會不知所措，甚至會自憂自恨，失去平安。但主耶穌這樣預告，是讓門徒知道一切都是在主耶穌的預知內，為叫他們在祂裡面得著平安。日後當門徒回想起主耶穌的預告，便知道祂是如何接納他們，並叫他們知道他們仍然「在主裡面」有平安，祂和門徒的關係不會因為他們「離祂逃跑」而終止。同時，主耶穌知道當祂回到父那裡去之後，門徒還要留在世上，正如從前主耶穌告訴門徒，他們必然會受到猶太人的逼迫苦害，甚至凡殺他們的，就以為是事奉神（約16:2）。因為愛門徒的緣故，主耶穌應許及安慰他們說：「在世上你們有苦難，但你們可以放心，我已經勝了世界。」其實主耶穌不是擔心門徒受的苦，祂是為著他們的信心而安慰勸勉他們，雖然日子難過，但主耶穌卻叫他們放心，因為祂已經勝了世界。祂如何勝了世界呢？當時的門徒尚未能明白，直到後來主復活以後，祂敗壞了掌死權的魔鬼，成就了父神的救贖計劃，門徒便能想起主所說的話，他們的信心得著堅固，並且真的安心了。
17章1至2節，本章經文被譽為「大祭司的禱告」，主耶穌在臨別勸勉門徒之後，祂便向父神禱告。本段是主耶穌為父神差遣自己成就的救贖計劃禱告，祂說完了上文的勸勉後，就舉目望天說：「父啊，時候到了，願你榮耀你的兒子，使兒子也榮耀你。」「舉目望天」是指主耶穌向著父神的禱告，「時候到了」是約翰福音中最後一次提到主耶穌的「時候或時辰」，這是指父神榮耀祂及使祂也榮耀父神的時候。此處的「榮耀」無疑是關乎主耶穌即將成就的救恩而彰顯出來之榮耀。救恩是因著主的受死、復活和被高舉而成全，父神將自己的獨生兒子賜給世人，並且兒子自己也甘心順服，以致於死。所以，父榮耀「兒子」，使兒子也榮耀父。主耶穌進一步說明「榮耀」的意思包括了「權柄」和「永生（生命）」，就是「正如你曾賜給他權柄管理凡有血氣的，叫他將永生賜給你所賜給他的人。」這裡的「權柄」是對著凡有血氣的說，父神賜給祂兒子管理全人類的權柄，參考約翰福音中記述父神賜主耶穌的權柄，包括了「行審判的權柄（約5:27）」和「捨命和取回命的權柄（約10:18）」。所以，「管理的權柄」包括了審判和生命，就是主耶穌有權為世人付上生命的贖價，叫一切信祂的人不被定罪，並將永生賜給凡相信的人。因此，主耶穌是為成就救贖而禱告父神，最終的目的是榮耀父神。
3至5節，何謂「永生」？人怎樣才能得到永生呢？主耶穌指出永生就是「認識你獨一的真神，並且認識你所差來的耶穌基督，這就是永生。」昔日神把亞當趕出伊甸園，人類便與神分隔，那是屬靈上的死（創2:17、3:24）。但現今人有機會藉著信而得著永生，在屬靈生命上恢復和神的關係。而本節的「認識真神和耶穌基督」，並不是指頭腦上認識，而是透過接受基督的救贖，重新與神建立一個屬靈生命的關係。主耶穌又禱告說：「我在地上已經榮耀你，你所託付我的事，我已成全了。」主耶穌在地上已經榮耀父神，因為父神差祂到世上要作的那事（the work單數），祂都成全了。那事必然是成就十字架的救贖計劃，主耶穌完成了神交給祂最重要的使命，叫父神因此得榮耀。現在主耶穌為「榮耀」的第二方面禱告說：「父啊，現在求你使我同你享榮耀，就是未有世界以先，我同你所有的榮耀。」為了成就救贖世人的計劃，神的兒子不以自己與父神同等為強奪的，反倒虛己，取了奴僕的形像，成為人的樣式。主耶穌隱藏了創世以前所享有的榮耀，並存心順服，以致於死，且死在十字架上（腓2:6-8）。當救恩即將成全，神的兒子禱告父神，求父在祂釘十架後，恢復祂原來與父同享的榮耀。父神也確實將主耶穌「升為至高，又賜給祂那超乎萬名以上的名，叫一切在天上的，地上的，和地底下的，因耶穌的名，無不屈膝，無不口稱耶穌基督為主，使榮耀歸與父神」（參腓2:9-11 ）。筆者想到主耶穌的謙卑實在叫人驚歎，祂不單在降世之先順服父神的旨意，並且在忠心完成父神的託付後，祂不是理所當然的自取恢復之前的榮耀。作為兒子，祂還是以尊重父神的態度來表達自己的願望。創世之前，主耶穌原是與父同等、同尊、同榮，但現在祂卻禱告父神，請求恢復祂從前同父神所有的榮耀。父神也實在將祂升為至高，可見父與子之間是何等的合一。