16章1至4節，法利賽人和撒都該人原是敵對的關係，但這次他們卻聯合起來試探耶穌。他們明顯不是要尋求認識主，早在馬太福音12章38節，已經有幾個文士和法利賽人表示他們願意主顯個神蹟給他們看。當時主拒絕了他們，今次他們同樣請主顯個神蹟給他們看，但他們不單要看神蹟，但加上了要「從天上」顯這個神蹟。他們不信耶穌是彌賽亞，希望借此難題來難倒主，便證明祂不是從神而來的。他們要「天上」，主便以天上的事來諷刺他們，他們知道分辨天上陰晴的變化，卻不能分辨主多次所行的神蹟。他們沒有屬靈的分辨能力，主卻能分辨這是個邪惡淫亂的世代，他們根本就是背叛神，現在卻說要天上而來的神蹟。主再次以12章所講「約拿的神蹟」來回應他們，除此以外，再沒有神蹟給他們看，主就離開他們。
5至12節，主提醒門徒要防備法利賽人和撒都該人的酵，他們因當時忘了帶餅而誤會主的意思。主看出他們所議論的，便糾正他們，並且責備他們小信。從門徒的反應，他們的著眼點是有沒有餅，但主提醒他們從前那兩次喂飽五千人和四千人的經歷，既曾經主大能的供應，為何現在又擔心沒有帶餅的問題呢！這實在也是我們的光景，從前我們一次又一次蒙神保守，但現在總會為生活而憂慮。主提醒門徒（包括我們）要關心屬靈的爭戰，這時門徒才明白主是叫他們防備法利賽人和撒都該人的教訓，兩種人都是要否定主是從神而來的彌賽亞。同樣，今天若有任何的道理叫我們懷疑主的身份，我們都應防備。
13至20節，主問門徒一般人說祂是誰，門徒回答了幾個說法，但意思都是說主是類似先知的身份。主又問門徒，他們自己怎樣看主，彼得回答說：「你是基督，是永生神的兒子。」基督就是那位要來的彌賽亞，拯救以色列人，彼得從他過去經歷主的神蹟和聽到祂的教訓，便認識人子是從神而來要的那位神的兒子。主指出彼得因為有這看見，實在是有福的。但這看見並不是人指示他的，乃是天父指示他。主在18節所說的「這磐石」，並不是指彼得，因為主用「你」來稱呼彼得是有福的，但主卻用「他」形容這磐石。因為彼得對主說：「你是基督，是永生神的兒子。」這表明他對主耶穌的「認信」。教會也是建造在這「認信」的基礎上，陰間的權柄不能勝過他（指「認信」），故唯有這樣「認信」的人才能信主得救。主要把天國的鑰匙給「你」，是那些像彼得蒙天父指示祂心意的人，所以，教會擁有這樣屬靈的權柄，凡教會在地上所捆綁的，在天上也要捆綁；凡教會在地上所釋放的，在天上也要釋放。教會是真理的柱石和根基，福音從教會而傳出，屬靈的事也是由屬神的人來判定。這個時候，主還不想門徒以外的其他人知道祂是基督。
21至28節，從門徒認識主是基督開始，主才指示他們關乎祂在猶太人的宗教領袖手下將會受苦、被殺和復活的事，並且強調祂是「必須」上耶路撒冷去，既是父神的心意，也表明祂那成就救恩的意志。然而，主這份堅定的心意卻被彼得攔阻，彼得拉著主及勸祂萬不可以如此，又說這事必不臨到祂。早前彼得還表示主是基督，是神的兒子。從彼得這次的反應，固然反映他不明白父神的救贖計劃，但他顯然十分關心主，他不願意看到主受苦受死。對於彼得的勸阻，主非但不領情，祂轉過來更嚴嚴的責備彼得。作為主最親近的門徒、又蒙神指示認識主是神的兒子，現在主耶穌竟然稱他為「撒但」，就是以彼得如撒但一樣敵擋神。主要他退過後邊去，不要在前面攔阻主前行，就是主「必須」前行受苦受死和復活。主以彼得這次的勸阻為絆祂腳的，正因為彼得和主的關係，他的攔阻在主看來實在不應該。主解釋責備他的原因是因為他不體貼神的意思（神救贖的計劃），只體貼人的意思（他對主的感情和關係）。彼得是蒙神指示而認識主的人，他被責備實在是我們中間自以為明白真理的人之鑑戒。因為彼得的不該，主對門徒說：「若有人要跟從我，就當捨己。」捨己可以說是否定自己，不以自己的感受、意思和利益為重，相反是跟從主，走主所走的路，以主的心意為重，這樣的人可以放下一切對自己「有益」的事。今天在基督教中，有不少人在講「捨己」，但卻忽略了他在體貼誰的心意，縱然「攻克己身」只為顯出自己的「捨己」，其實骨子裡沒有跟從主的「捨己」，他仍然是體貼自己。主又說門徒要背起他們的十字架來跟從主，「十字架」不是容易忍受的，並且每個信徒都有自己的十字架，當我們為要成就神的旨意，我們就需要對付自己或放下自己所愛的人和物，這個放下肯定是產生掙扎和難受，或沒有掙扎，這便不是我們的十字架。雖然每個人的十字架都不同，但相同的是我們背十架是要跟從主，行主的路、效法基督，正如希伯來書12章2節：「祂因那擺在前面的喜樂，就輕看羞辱，忍受了十字架的苦難，便坐在神寶座的右邊。」因此，人在背十架中，心靈不是單單忍受，還是存著信心和盼望跟隨主的腳蹤向前行。主解釋那些設法顧念自己肉體的人，因而不願背起十架跟隨主，他們便會失喪屬靈的生命。相反，為主的緣故而喪掉肉體的生命，必在主裡得著屬靈寶貴的生命。主又反問「人若賺得全世界，賠上自己的生命，有甚麼益處呢？人還能拿甚麼換生命呢？」其實這個問題針對顧念今生的人，呼醒他們關心自己的靈魂。試問有誰真的能賺得全世界呢！主的意思是縱使有這樣的人，相比之下，他所賠上的永遠生命，也不能以全世界換取。全世界都是有限，又怎能與無限的生命相比。同時，當主再來的日子，祂要照各人的行為報應各人，所以，我們都應該要預備好迎見主，如何預備，就是「背起自己的十字架來跟從祂」。若有人不肯跟從主，到那日他要受到報應。最後，主告訴門徒，站在那裡的，有人在沒嘗死味以前，必看見人子降臨在他的國裡。祂是叫部份人看見這個屬靈的奧秘。「沒有嘗死味以前」是指「今生」，猶太人的觀念是人死後的靈魂才可以看到天上的國，但主卻指出有門徒還在世上已能看見「神的國」。